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      水稻顯性半矮稈基因的SCAR標記及初步定位.pdf

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        編號:20190301090030302    類型:共享資源    大?。?span class="font-tahoma">2.89MB    格式:PDF    上傳時間:2024-01-04
          
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        水稻 半矮稈 顯性基因 RAPD標記 SCAR標記 基因定位
        資源描述:
          粳型水稻Y98149是從離子束誘變后代中獲得的顯性半矮稈突變體。本研究利用RAPD方法在水稻顯性半矮稈突變體Y98149和其野生型Y98148之間進行了RAPD標記篩選工作,從基因組水平上揭示了兩者的差異程度,為突變的基因提供分子生物學證據。對穩定的多態性RAPD標記進行了SCAR標記轉化,成功地獲得了與3個與水稻顯性半矮稈基因連鎖的SCAR標記,并對克隆的RAPD標記進行了相關序列分析,結果表明:1、利用1100個10堿基寡核苷酸隨機引物篩選Y98148和Y98149,共獲得4個穩定的多態性引物。2、通過計算得到突變體Y98149與其野生型Y98148的相似系數為0.9995,遺傳距離為0.0005,表明Y98148與Y98149遺傳背景具有極高的相似性。3、通過克隆、測序,成功地得到3個RAPD標記的序列。4根據所測的序列設計特異性引物,并在近等基因系間進行了PCR分析,成功地將RAPD標記S1041525、S1076549、S1272403轉化為SCAR標記SCS1041498、SCS1076510、SCS12723884、利用Y98148×Y98149的F2分離群體384個單株對SCAR標記進行了驗證和連鎖分析,SCAR標記SCS1041498、SCS1076510和SCS1272388PCR擴增結果與田間農藝性狀吻合率分別為88.8﹪、93.2﹪和85.2﹪,與顯性半矮稈基因的遺傳距離分別為12.6cM、7.5cM和16.3cM5、通過序列分析和同源性搜索,片段S1041525和S1076549分別編碼111和90個氨基酸序列的多肽,其中S1076549的多肽序列與原核生物的蔗糖磷酸轉移酶基因有94﹪的同源性,與一些植物中的膜蛋白也有相當高的同源性。片段S1272403的核苷酸序列與水稻第七染色體上的兩個BAC克隆B1249D05(AP006451)和OJ1212C12(AP005604)同源性為99﹪,B1249D05和OJ1212_C12是重疊克隆,S1272403位于二者重疊區域中,進而初步將水稻顯性半矮稈基因定位于第七染色體上。
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        本文標題:水稻顯性半矮稈基因的SCAR標記及初步定位.pdf
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        三秋桂子上傳于2024-01-04

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